MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 51990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	AT	3	6	621	626	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
2	NC_011899	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
3	NC_011899	CTGG	2	8	760	767	0 %	25 %	50 %	25 %	220930851
4	NC_011899	TTA	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930851
5	NC_011899	GAA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
6	NC_011899	TGC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930851
7	NC_011899	CCCGG	2	10	1042	1051	0 %	0 %	40 %	60 %	220930851
8	NC_011899	TA	3	6	1069	1074	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
9	NC_011899	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
10	NC_011899	GAT	2	6	1208	1213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930851
11	NC_011899	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	220930851
12	NC_011899	TCC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930851
13	NC_011899	AAAG	2	8	1289	1296	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
14	NC_011899	GAA	2	6	1304	1309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
15	NC_011899	T	6	6	1310	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	220930851
16	NC_011899	ATA	2	6	1355	1360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
17	NC_011899	GAAA	2	8	1378	1385	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
18	NC_011899	AG	3	6	1399	1404	50 %	0 %	50 %	0 %	220930851
19	NC_011899	A	7	7	1483	1489	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
20	NC_011899	ATTA	2	8	1579	1586	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
21	NC_011899	ATAGAT	2	12	1622	1633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220930851
22	NC_011899	AGG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930851
23	NC_011899	TGG	2	6	1659	1664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930851
24	NC_011899	ATA	2	6	1671	1676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930851
25	NC_011899	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
26	NC_011899	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930851
27	NC_011899	AGA	2	6	1744	1749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930851
28	NC_011899	AAAGA	2	10	1759	1768	80 %	0 %	20 %	0 %	220930851
29	NC_011899	TTC	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930851
30	NC_011899	GGA	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930851
31	NC_011899	TAC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930851
32	NC_011899	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
33	NC_011899	GAT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930851
34	NC_011899	GATA	2	8	1942	1949	50 %	25 %	25 %	0 %	220930851
35	NC_011899	A	6	6	1959	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	220930851
36	NC_011899	GC	3	6	2385	2390	0 %	0 %	50 %	50 %	220930852
37	NC_011899	TCT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930852
38	NC_011899	CCAG	2	8	2542	2549	25 %	0 %	25 %	50 %	220930852
39	NC_011899	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
40	NC_011899	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
41	NC_011899	TGA	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
42	NC_011899	TTCAAC	2	12	2766	2777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930852
43	NC_011899	ATAC	2	8	2852	2859	50 %	25 %	0 %	25 %	220930852
44	NC_011899	GAAA	2	8	2903	2910	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
45	NC_011899	TGA	3	9	2958	2966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
46	NC_011899	TTTAAT	2	12	3007	3018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
47	NC_011899	CAG	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930852
48	NC_011899	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930852
49	NC_011899	TTA	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
50	NC_011899	AAG	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
51	NC_011899	ATT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930852
52	NC_011899	AGA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
53	NC_011899	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930852
54	NC_011899	ATG	3	9	3329	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
55	NC_011899	CTTTAA	2	12	3371	3382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	220930852
56	NC_011899	AGAA	2	8	3383	3390	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
57	NC_011899	TGA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930852
58	NC_011899	TTTA	2	8	3403	3410	25 %	75 %	0 %	0 %	220930852
59	NC_011899	CCG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220930852
60	NC_011899	A	6	6	3476	3481	100 %	0 %	0 %	0 %	220930853
61	NC_011899	GGA	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930853
62	NC_011899	CAGG	2	8	3550	3557	25 %	0 %	50 %	25 %	220930853
63	NC_011899	GAA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930853
64	NC_011899	TATT	2	8	3684	3691	25 %	75 %	0 %	0 %	220930854
65	NC_011899	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
66	NC_011899	ATA	2	6	3734	3739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
67	NC_011899	TTG	2	6	3752	3757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930854
68	NC_011899	CTT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930854
69	NC_011899	AG	3	6	3841	3846	50 %	0 %	50 %	0 %	220930854
70	NC_011899	TGT	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930854
71	NC_011899	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
72	NC_011899	A	7	7	3942	3948	100 %	0 %	0 %	0 %	220930854
73	NC_011899	ATG	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
74	NC_011899	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
75	NC_011899	GGA	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930854
76	NC_011899	ATTACC	2	12	4103	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930854
77	NC_011899	A	7	7	4119	4125	100 %	0 %	0 %	0 %	220930854
78	NC_011899	TAA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
79	NC_011899	TAC	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930854
80	NC_011899	CCT	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220930854
81	NC_011899	AGC	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930854
82	NC_011899	ATA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
83	NC_011899	GAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
84	NC_011899	TAA	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
85	NC_011899	GAT	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
86	NC_011899	CAG	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930854
87	NC_011899	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930854
88	NC_011899	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	220930854
89	NC_011899	ATA	2	6	4640	4645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
90	NC_011899	AAG	2	6	4647	4652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930854
91	NC_011899	TTA	2	6	4694	4699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930854
92	NC_011899	T	7	7	4710	4716	0 %	100 %	0 %	0 %	220930854
93	NC_011899	TAA	2	6	4772	4777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930854
94	NC_011899	AT	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	220930855
95	NC_011899	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930855
96	NC_011899	GAA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930855
97	NC_011899	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930855
98	NC_011899	TTTTG	2	10	4982	4991	0 %	80 %	20 %	0 %	220930855
99	NC_011899	CA	3	6	5028	5033	50 %	0 %	0 %	50 %	220930855
100	NC_011899	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930855
101	NC_011899	T	6	6	5097	5102	0 %	100 %	0 %	0 %	220930856
102	NC_011899	ATGG	2	8	5200	5207	25 %	25 %	50 %	0 %	220930856
103	NC_011899	CCA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220930856
104	NC_011899	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930856
105	NC_011899	TGA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930856
106	NC_011899	TTA	2	6	5285	5290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
107	NC_011899	A	6	6	5362	5367	100 %	0 %	0 %	0 %	220930856
108	NC_011899	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930856
109	NC_011899	GGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930856
110	NC_011899	TGT	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930856
111	NC_011899	CTG	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220930856
112	NC_011899	ATT	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
113	NC_011899	AGG	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930856
114	NC_011899	GAATAA	2	12	5796	5807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220930856
115	NC_011899	TGA	2	6	5820	5825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930856
116	NC_011899	ATG	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930856
117	NC_011899	AAT	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930856
118	NC_011899	ATG	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220930856
119	NC_011899	GGA	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930856
120	NC_011899	GGAA	2	8	6057	6064	50 %	0 %	50 %	0 %	220930856
121	NC_011899	TAT	2	6	6072	6077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
122	NC_011899	AGACCA	2	12	6113	6124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220930856
123	NC_011899	TTG	2	6	6152	6157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220930856
124	NC_011899	CCTT	2	8	6185	6192	0 %	50 %	0 %	50 %	220930856
125	NC_011899	GCC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220930856
126	NC_011899	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	220930856
127	NC_011899	TTC	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220930856
128	NC_011899	TA	3	6	6370	6375	50 %	50 %	0 %	0 %	220930856
129	NC_011899	GGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220930856
130	NC_011899	CAA	2	6	6495	6500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220930856
131	NC_011899	GAA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220930856
132	NC_011899	TAA	2	6	6518	6523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930856
133	NC_011899	ATAA	2	8	6559	6566	75 %	25 %	0 %	0 %	220930856
134	NC_011899	AAT	2	6	6582	6587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220930856
135	NC_011899	CCGATG	2	12	6596	6607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220930856
136	NC_011899	AT	4	8	6685	6692	50 %	50 %	0 %	0 %	220930856
137	NC_011899	ACT	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220930856
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139	NC_011899	TAT	2	6	6876	6881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220930856
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143	NC_011899	GGAT	2	8	7253	7260	25 %	25 %	50 %	0 %	220930857
144	NC_011899	GGA	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220930857
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262	NC_011899	GAC	2	6	12466	12471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930860
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264	NC_011899	GAC	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220930860
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